Jeden z najstarszych i najciekawszych obiektów sakralnych miasta. Historia zabytku jest bardzo burzliwa i wiąże się ściśle z dziejami zakonu franciszkanów w Kłodzku. Budowa kościoła i klasztoru rozpoczęła się prawdopodobnie w 1270 r. Kościół w swojej historii doznał poważnych szkód w wyniku licznych powodzi jakie nawiedzały miasto. Obecna barokowa świątynia wzniesiona została na początku XVII wieku. We wnętrzu zespołu klasztornego do dnia dzisiejszego zachowały się freski Feliksa Antoniego Schefflera, zdobiące sklepienie sali jadalnej. W klasztorze zorganizowano pierwszą w Kłodzku drukarnię.